Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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