Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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