Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 TRAF5-203ENST00000367004 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 BIVM-201ENST00000257336 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 TMEM185A-210ENST00000613273 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 TLE4-201ENST00000265284 2382 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 HGNC:18790-209ENST00000513555 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 EPHB6-201ENST00000411471 3367 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 DCAKD-203ENST00000452796 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 SMARCA1-201ENST00000371121 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 CR2-202ENST00000367058 4063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 LINC01134-203ENST00000442673 3059 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AC012676.5-201ENST00000624337 1955 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 EXD2-206ENST00000409949 2688 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 LINC00365-201ENST00000413591 2618 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 LINC01254-201ENST00000566225 2908 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MRO-203ENST00000428869 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 SLC18A1-201ENST00000265808 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ZNF75D-201ENST00000370764 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 DCK-204ENST00000504952 2614 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ATP2A1-201ENST00000357084 3532 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 LLGL2-205ENST00000577200 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 LPIN1-209ENST00000449576 3077 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 CELF2-AS1-201ENST00000379256 2468 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 DCT-202ENST00000446125 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MFAP4-201ENST00000299610 1873 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 MFAP4-203ENST00000497081 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 ELMO1-201ENST00000310758 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CD300CQ08708 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms