Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms