Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD3P84022 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms