Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms