Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD1P28340 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
POLD1P28340 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
POLD1P28340 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
POLD1P28340 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms