Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms