Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms