Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GIPC1O14908 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms