Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CLDN34H7C241 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms