Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms