Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TTC7AQ9ULT0 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms