Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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