Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms