Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHPF2Q9P2E5 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms