Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms