Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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