Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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