Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ATG4DQ86TL0 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ATG4DQ86TL0 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ATG4DQ86TL0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ATG4DQ86TL0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ATG4DQ86TL0 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ATG4DQ86TL0 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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