Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms