Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms