Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRB1P82279 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRB1P82279 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms