Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN10P78369 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN10P78369 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN10P78369 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN10P78369 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN10P78369 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN10P78369 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN10P78369 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN10P78369 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN10P78369 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN10P78369 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN10P78369 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN10P78369 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN10P78369 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN10P78369 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN10P78369 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms