Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPFP62306 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms