Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC097493.2-201ENST00000468675 780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 CARD8-224ENST00000522431 622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms