Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMPOP42166 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMPOP42166 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMPOP42166 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms