Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPB2P35606 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPB2P35606 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms