Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms