Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms