Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TFE3P19532 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TFE3P19532 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TFE3P19532 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TFE3P19532 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TFE3P19532 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TFE3P19532 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TFE3P19532 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TFE3P19532 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TFE3P19532 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TFE3P19532 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TFE3P19532 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TFE3P19532 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TFE3P19532 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TFE3P19532 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TFE3P19532 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TFE3P19532 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TFE3P19532 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TFE3P19532 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TFE3P19532 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TFE3P19532 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms