Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms