Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms