Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLA1P09884 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLA1P09884 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLA1P09884 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLA1P09884 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLA1P09884 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLA1P09884 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
POLA1P09884 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLA1P09884 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms