Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AL033381.2-201ENST00000603854 732 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AC010776.3-201ENST00000617349 424 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 TUBAP-201ENST00000425085 1352 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 HBD-202ENST00000380299 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AL355075.5-201ENST00000553568 890 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AP003062.1-201ENST00000528497 762 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 DNM1P50-201ENST00000565767 508 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 RTP2-201ENST00000358241 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AC002066.1-201ENST00000446355 514 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PKHD1P08F94 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms