Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZBED1O96006 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZBED1O96006 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ZBED1O96006 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZBED1O96006 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZBED1O96006 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZBED1O96006 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZBED1O96006 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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ZBED1O96006 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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ZBED1O96006 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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ZBED1O96006 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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ZBED1O96006 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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