Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms