Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms