Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms