Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms