Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RCOR3Q9P2K3 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCOR3Q9P2K3 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCOR3Q9P2K3 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCOR3Q9P2K3 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCOR3Q9P2K3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCOR3Q9P2K3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCOR3Q9P2K3 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCOR3Q9P2K3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCOR3Q9P2K3 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCOR3Q9P2K3 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCOR3Q9P2K3 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RCOR3Q9P2K3 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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