Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms