Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms