Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PDCD1Q15116 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PDCD1Q15116 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PDCD1Q15116 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PDCD1Q15116 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PDCD1Q15116 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PDCD1Q15116 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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