Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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