Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 STRA6-201ENST00000323940 2864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 LPXN-203ENST00000528954 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 LINC01164-201ENST00000341866 3384 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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