Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPM4P67936 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPM4P67936 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPM4P67936 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TPM4P67936 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPM4P67936 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms