Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms