Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms