Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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